Secuenciación genoma

La complicada genética de la caña de azúcar hizo que fuera el último cultivo importante sin un genoma completo y altamente preciso. Ahora, científicos de Francia, Australia, República Checa y Estados Unidos, dirigidos por el Instituto Conjunto del Genoma (JGI) del Departamento de Energía de Estados Unidos, han desarrollado y combinado múltiples técnicas para mapear con éxito el código genético de la caña de azúcar. El genoma de la caña de azúcar es grande y contiene más copias de cromosomas que una planta típica, una característica llamada poliploidía. La caña de azúcar tiene alrededor de 10.000 millones de pares de bases, mientras que el genoma humano tiene alrededor de 3.000 millones. Muchas secciones del ADN de la caña de azúcar son idénticas tanto

Un equipo internacional, que incluye científicos del Laboratorio Fei del Instituto Boyce Thompson (BTI), ha secuenciado los genomas de especies clave de pimiento cultivadas y silvestres, ofreciendo información sin precedentes sobre la evolución, domesticación y diversidad genética de la pimienta. El género Capsicum, comúnmente llamado pimienta o pimentón, pertenece a la familia de las solanáceas, que incluye alrededor de 35 especies. El equipo de investigación descubrió que las dos principales especies domesticadas se han criado selectivamente de diferentes maneras, afectando rasgos como el tamaño, la forma y el picante del fruto. También encontraron que algunas especies tomaron prestados rasgos genéticos de otras, lo que podría ayudarlas a combatir mejor las plagas y el estrés ambiental. Los investigadores reunieron genomas de alta calidad

Una investigación internacional en la que participa el Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (I2SysBio), centro mixto del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y la Universitat de València, consigue completar las versiones 4 y 5 del genoma de referencia de la vid (vitis vinifera) en las que se encuentran una gran cantidad de genes relacionados con la respuesta al estrés por plagas, por la falta de agua o genes determinantes de la capacidad aromática de los frutos. La información obtenida permitirá diseñar el viñedo del futuro más resistente al cambio climático que amenaza gravemente a la industria del vino. Estos trabajos han sido publicados en las revistas Horticulture Research y G3 Genes|Genomes|Genetics. Si bien la secuenciación de la vid se completó, por

Científicos informáticos de la Universidad DePaul en los Estados Unidos ha utilizado un flujo de trabajo de bioinformática para reconstruir uno de los genomas más completos de una de las principales especies de algodón, el cultivar Wagad de Gossypium herbaceum domesticado en África, lo que les dio a los científicos una imagen más completa de cómo se domesticó el algodón silvestre a lo largo del tiempo. El equipo de investigación está dirigido por Thiru Ramaraj, profesora asistente de informática en el Jarvis College of Computing and Digital Media de DePaul y también autora principal de la publicación en la revista G3: Genes, Genomes, Genetics. Su trabajo comenzó con el procesamiento de datos de secuencias de ADN. Reconstruyeron el genoma de

Un equipo de investigación internacional dirigido por científicos del Instituto de Ciencias de Cultivos de la Academia China de Ciencias Agrícolas (CAAS) ha publicado el pangenoma de la Setaria (Foxtail millet), un importante cultivo de cereales, un género de plantas herbáceas de la familia de las poáceas originario de las regiones templadas y tropicales. Junto con científicos de la Universidad de Nueva York (NYU), la investigación avanza en la comprensión de la domesticación y evolución de la Setaria, así como en la base genética de importantes rasgos agrícolas. En el artículo publicado en Nature Genetics, los investigadores establecieron el pan-genoma de Setaria ensamblando 110 genomas representativos de una colección global de 1.844 especies de Setaria. Se realizaron estudios genéticos a gran escala para 68 rasgos en 22 entornos